Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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