Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms