Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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