Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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TNXAQ16473 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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TNXAQ16473 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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TNXAQ16473 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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TNXAQ16473 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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TNXAQ16473 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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