Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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EXT1Q16394 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXT1Q16394 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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EXT1Q16394 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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EXT1Q16394 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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EXT1Q16394 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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EXT1Q16394 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXT1Q16394 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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