Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALX1Q15699 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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