Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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