Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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