Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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