Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.9 ms