Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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