Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms