Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATP1A4Q13733 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ATP1A4Q13733 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATP1A4Q13733 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATP1A4Q13733 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ATP1A4Q13733 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms