Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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