Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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