Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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