Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RIGQ13278 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RIGQ13278 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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