Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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