Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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TRAF3Q13114 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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