Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms