Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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ECH1Q13011 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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ECH1Q13011 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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ECH1Q13011 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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ECH1Q13011 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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