Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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