Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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