Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms