Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMARCB1Q12824 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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