Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
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PTPRBP23467 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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PTPRBP23467 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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