Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRHP20396 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRHP20396 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRHP20396 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRHP20396 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRHP20396 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRHP20396 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRHP20396 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms