Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms