Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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