Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms