Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GINS3Q9BRX5 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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