Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms