Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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C9orf135Q5VTT2 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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C9orf135Q5VTT2 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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C9orf135Q5VTT2 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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C9orf135Q5VTT2 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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C9orf135Q5VTT2 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
C9orf135Q5VTT2 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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