Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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USP41Q3LFD5 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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USP41Q3LFD5 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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USP41Q3LFD5 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP41Q3LFD5 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP41Q3LFD5 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP41Q3LFD5 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP41Q3LFD5 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP41Q3LFD5 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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