Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDO1Q16878 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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