Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTN1Q16799 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTN1Q16799 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTN1Q16799 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTN1Q16799 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTN1Q16799 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTN1Q16799 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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RTN1Q16799 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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RTN1Q16799 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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