Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CTF1Q16619 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CTF1Q16619 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CTF1Q16619 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CTF1Q16619 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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CTF1Q16619 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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