Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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ZNF239Q16600 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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ZNF239Q16600 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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ZNF239Q16600 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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