Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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