Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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