Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NPTX1Q15818 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
NPTX1Q15818 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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