Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
NCOA1Q15788 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NCOA1Q15788 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms