Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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SS18Q15532 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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SS18Q15532 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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SS18Q15532 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SS18Q15532 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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SS18Q15532 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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SS18Q15532 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
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SS18Q15532 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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SS18Q15532 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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SS18Q15532 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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SS18Q15532 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SS18Q15532 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SS18Q15532 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SS18Q15532 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SS18Q15532 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
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