Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDSNQ15517 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms