Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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