Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SIX1Q15475 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SIX1Q15475 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SIX1Q15475 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SIX1Q15475 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SIX1Q15475 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SIX1Q15475 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SIX1Q15475 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SIX1Q15475 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SIX1Q15475 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SIX1Q15475 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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