Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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SEC23BQ15437 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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