Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDK3Q15120 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms