Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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