Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBM39Q14498 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.3 ms